Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDK4Q16654 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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