Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 518.92■□□□□ 0.621e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 517.54■□□□□ 0.41e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 316.53■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 515.92■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 514.46□□□□□ -0.091e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 213.86□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 313.86□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 512.32□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 512.03□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 311.22□□□□□ -0.611e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 58.95□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 38.08□□□□□ -1.121e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.97□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.97□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.178e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.018e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.118e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.268e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-216ENST00000550184 1564 ntTSL 511.79□□□□□ -0.528e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.598e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.738e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.768e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.88e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 59.81□□□□□ -0.848e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 SHF-211ENST00000561278 578 ntTSL 49.63□□□□□ -0.878e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 29.35□□□□□ -0.918e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 AC051619.8-201ENST00000563103 308 ntBASIC8.58□□□□□ -1.048e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-206ENST00000547408 683 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.178e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 57.73□□□□□ -1.178e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 37.04□□□□□ -1.288e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.38e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.38e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.438e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 35□□□□□ -1.618e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.638e-8■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.488e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 219.49■□□□□ 0.714e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 218.47■□□□□ 0.554e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 315.34■□□□□ 0.054e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 215.11■□□□□ 0.014e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 314.79□□□□□ -0.044e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 214.09□□□□□ -0.154e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.168e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-205ENST00000477395 762 ntTSL 513.74□□□□□ -0.218e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 312.45□□□□□ -0.424e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.464e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.558e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.574e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-208ENST00000537745 1065 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.18e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-207ENST00000536606 572 ntTSL 37.78□□□□□ -1.168e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.238e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 57.06□□□□□ -1.288e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.378e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MAT2A-204ENST00000469221 691 ntTSL 25.69□□□□□ -1.54e-7■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 25.6□□□□□ -1.518e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 RAN-206ENST00000535090 657 ntTSL 54.1□□□□□ -1.758e-16■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 NDUFAF8-202ENST00000573090 741 ntTSL 317.02■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MBTPS1-210ENST00000565863 597 ntTSL 415.97■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 NDUFAF8-204ENST00000575067 177 ntTSL 315.73■□□□□ 0.113e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 NDUFAF8-206ENST00000577158 278 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.083e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.073e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MBTPS1-213ENST00000569770 763 ntTSL 315.26■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLASRP-205ENST00000585432 290 ntTSL 214.69□□□□□ -0.063e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 213.55□□□□□ -0.243e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.253e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 NDUFAF8-205ENST00000576002 365 ntTSL 211.82□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.543e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 UBC-204ENST00000536661 624 ntTSL 211.61□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 211.51□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.593e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.593e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.883e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MBTPS1-206ENST00000563231 546 ntTSL 58.19□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 UBC-211ENST00000542416 517 ntTSL 46.92□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MBTPS1-203ENST00000562788 431 ntTSL 26.46□□□□□ -1.383e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 MBTPS1-209ENST00000564643 602 ntTSL 36.36□□□□□ -1.393e-6■□□□□ 9.8
SRSF7Q16629 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.584e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 59.9□□□□□ -0.834e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 59.79□□□□□ -0.844e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.94e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-209ENST00000578758 667 ntTSL 28.39□□□□□ -1.074e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-213ENST00000579996 820 ntTSL 27.03□□□□□ -1.284e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 26.95□□□□□ -1.34e-9■□□□□ 9.7
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