Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ECM1Q16610 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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