Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F4Q16254 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F4Q16254 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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