Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ZIC1Q15915 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZIC1Q15915 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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