Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALX1Q15699 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALX1Q15699 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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