Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms