Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTF1Q15361 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTF1Q15361 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTF1Q15361 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms