Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT31Q15323 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT31Q15323 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT31Q15323 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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