Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK1Q15118 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK1Q15118 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms