Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms