Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCLAFQ15004 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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