Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCAPHQ15003 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAPHQ15003 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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