Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRCAPQ14761 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCAPQ14761 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms