Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC1AQ14683 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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