Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SQLEQ14534 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms