Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCINQ13939 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCINQ13939 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCINQ13939 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCINQ13939 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCINQ13939 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCINQ13939 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCINQ13939 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCINQ13939 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCINQ13939 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCINQ13939 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCINQ13939 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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