Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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