Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR4Q13639 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR4Q13639 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms