Protein–RNA interactions for Protein: Q13621

SLC12A1, Solute carrier family 12 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A1Q13621 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A1Q13621 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A1Q13621 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms