Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTM1Q13496 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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