Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN4PQ13434 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms