Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PMS2P3Q13401 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMS2P3Q13401 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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