Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCGQ13326 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCGQ13326 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCGQ13326 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGCGQ13326 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCGQ13326 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCGQ13326 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCGQ13326 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCGQ13326 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCGQ13326 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCGQ13326 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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