Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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SCGB2A2Q13296 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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