Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME3Q13232 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME3Q13232 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME3Q13232 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME3Q13232 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME3Q13232 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME3Q13232 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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