Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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