Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN3Q13064 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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