Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK2Q13002 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK2Q13002 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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