Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXF2Q12947 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXF2Q12947 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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