Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN1Q12860 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms