Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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