Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 ERV1YGR029W 570 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 DPH1YIL103W 1278 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 CSE4YKL049C 690 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 snR24snR24 89 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YML096WYML096W 1578 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 NAF1YNL124W 1479 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 SSF2YDR312W 1362 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 STE5YDR103W 2754 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 TDA2YER071C 381 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RPL8AYHL033C 771 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 CRG1YHR209W 876 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 UBX2YML013W 1755 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 MSE1YOL033W 1611 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 SMF2YHR050W 1650 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 ERO1YML130C 1692 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RFA1YAR007C 1866 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YCK3YER123W 1575 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 ADY2YCR010C 852 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YCR101CYCR101C 549 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 ARF2YDL137W 546 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YIR020CYIR020C 303 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YLR031WYLR031W 561 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YML018CYML018C 1182 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 TAF14YPL129W 735 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 SKI2YLR398C 3864 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 HRR25YPL204W 1485 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 ARB1YER036C 1833 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 CHA4YLR098C 1947 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 EMW1YNL313C 2715 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 ASI3YNL008C 2031 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YER038W-AYER038W-A 381 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 CIS3YJL158C 684 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RPL17BYJL177W 555 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 UTP11YKL099C 753 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 SMA2YML066C 1110 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 ISF1YMR081C 1017 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YBR032WYBR032W 303 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 SUB2YDL084W 1341 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 GPB1YOR371C 2694 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 MDL1YLR188W 2088 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 UTP9YHR196W 1728 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 GCS1YDL226C 1059 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 TFB3YDR460W 966 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RSM25YIL093C 795 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 SUP35YDR172W 2058 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 VPS33YLR396C 2076 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 POP1YNL221C 2628 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 QCR6YFR033C 444 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 SAE2YGL175C 1038 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 VTI1YMR197C 654 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 HEM4YOR278W 828 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RDL2YOR286W 450 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 CAM1YPL048W 1248 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 VHR1YIL056W 1923 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 NGL3YML118W 1518 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YIL055CYIL055C 1884 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YER079C-AYER079C-A 339 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 VOA1YGR106C 798 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RNR4YGR180C 1038 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 BET5YML077W 480 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 RAD14YMR201C 1116 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 INN1YNL152W 1230 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 NRM1YNR009W 750 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YPL107WYPL107W 747 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 DER1YBR201W 636 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 IMA5YJL216C 1746 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 NTH1YDR001C 2256 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 PAC2YER007W 1557 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 APS3YJL024C 585 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YKL107WYKL107W 930 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 NOP15YNL110C 663 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RPL18AYOL120C 561 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 CDC33YOL139C 642 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 PTK2YJR059W 2457 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 BFR1YOR198C 1413 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YDL009CYDL009C 324 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 THR1YHR025W 1074 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YKL070WYKL070W 510 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RHO4YKR055W 876 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ATP14YLR295C 375 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YLR434CYLR434C 384 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 PAI3YMR174C 207 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 TRM112YNR046W 408 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 TUF1YOR187W 1314 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ERG1YGR175C 1491 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 DAL5YJR152W 1632 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YER023C-AYER023C-A 213 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RPL1BYGL135W 654 nt5.87□□□□□ -1.47
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