Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CGNL1Q0VF96 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNL1Q0VF96 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms