Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms