Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXL1Q08397 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms