Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms