Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFF3Q07654 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFF3Q07654 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms