Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A2Q05940 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms