Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP1Q04837 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms