Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms