Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARDQ03181 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARDQ03181 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms