Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPEQ02224 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPEQ02224 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPEQ02224 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms