Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1DQ01668 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms