Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFITM3Q01628 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms