Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEX3Q00994 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms