Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLTCQ00610 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLTCQ00610 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms