Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms