Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK16Q00536 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms