Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED6P86452 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms